Na área de combustíveis o Protheus realiza análises químicas em:
- matrizes fósseis (gasolina, diesel, xisto),
- renováveis (biodiesel);
- biocombustíveis em geral produzidos por processos de liquefação, pirólise e combustão;
- produtos de alcoolquímica);
- sintéticos (Fisher-Tropish e outros).
Realiza também análise de gases e materiais voláteis associados a estes processos.
